?

Log in

No account? Create an account
Quizzing the Anonymous
Ignoramus et ignorabimus
Recent Entries 
13th-Jan-2030 01:37 pm - [sticky post] Contents
thinking
If a man will begin with certainties, he shall end in doubts; but if he will be content to begin with doubts, he shall end in certainties. (Bacon)

Давно кругом меня о нем умолкнул слухCollapse )

Last updated on Sept 8, 2018
https://sites.google.com/site/shkrobius/table-of-lj-contents
14th-Oct-2018 08:09 pm - Канадские загадки
thinking
Гостил у сына в Монреале и увидел в местной газете неизвестную мне загадку (они ее binaire называют). Пишут, она возникла в Японии, оттуда перекинулась в Бельгию-Голландию, оттуда во Францию, теперь попала в Квебек, но дальше по континенту пока почему-то не пошла.

Есть квадрат 2Nx2N; в каждой строке и столбце N единиц и N нулей, все строки и столбцы уникальны, и в них не может быть более, чем два одинаковых символа подряд. Большинство символов стирают, и надо восстановить таблицу. Тут примеры
http://www.binarypuzzle.com/

Расторопные европейские математики уже навели теорию, как решать такие загадки
https://link.springer.com/content/pdf/10.1007%2Fs11786-017-0322-4.pdf

Сам я ничего лучше, чем backtrack-based search (= б/м тупой перебор) не придумал. По-моему, предложенное решение с переложением на язык полиномов и использование базиса Гребнера очень изящно.

***

Давно не ездил по Канаде: все вспоминал любимое стихотворение

Sweet maiden of Passamaquoddy,
Shall we seek for communion of souls
Where the deep Mississippi meanders,
Or the distant Saskatchewan rolls?
Ah, no! in New Brunswick we'll find it -
A sweetly sequestered nook -
Where the swift gliding Skoodoowabskooksis
Unites with the Skoodoowabskook.
Meduxnakik's waters are bluer;
Nepisiguit's pools are more black;
More green is the bright Oromocto,
And browner the Peticodiac.
But colours more radiant, in Autumn,
I see when I'm casting my hook,
In the waves of the Skoodoowabskooksis,
Or perhaps in the Skoodoowabskook.

etc. http://www.heirloomsreunited.com/2010/08/poem-maiden-of-quoddy-by-james-de-mille.html

Почему в викторианские времена была обсессия с непроизносимыми индейскими названиями? Я еще там понимаю про Чикаго в Иллиное, но ведь там такие села, что о них сломал язык бы даже гордый Гайвата, бесполезны ему б были рукавицы минджикэвон и тяжелый томагаук + дубинка поггэвогон...

***

К слову о географии, подумал - "над Канадой небо синее, меж берез дожди косые // хоть похоже на Россию, только все же не Россия" - докудова, интересно, добрался автор песни, чтоб такое написать на трезвую голову? Проверил - оказалось, Галифакс. Где ж в России похожие места-то?

13th-Oct-2018 02:25 pm - Индийский желтый
thinking
Мне нечего стыдиться: мои Тернеры висят в Лондоне, Нью-Йорке, Париже, Берлине, Вене.

Я прочел все, написанное о его живописи, - а это сотни полотен и акварелей, - я объездил все коллекции, где выставлены эскизы, а их десятки тысяч. За двадцать лет я скопировал, наверно, полста его картин. У меня целая библиотека; я слежу за новинками, и моя лаборатория оборудована не хуже, чем любая университетская. Я пишу немного - одно-два полотна в год - но это настоящие шедевры, и то, что их написал не Тернер, а я - печальное недоразумение, вот и все. Если бы Тернер жил дольше, он бы их непременно написал.

***

Гром разразился среди ясного неба, - как буря на море, которую любил рисовать Тернер. Помните пожар здания парламента - столб огня над рекой? Или рассвет над кораблем невольников? Или ангела, вылетающего из солнца? Что между ними общего?

Эту краску увидели на индийских миниатюрах, но никто не знал, откуда брался пигмент - пиури, который англичане прозвали "индийским желтым". Пигмент можно было купить у перекупщиков, но он был так редок и проходил через так много рук, что никто не мог установить его происхождение. Тернер обожал его, и "индийский желтый" у него повсюду. В 1880-х годах один лондонский ботаник нанял некоего мистера Мухараджи выяснить, наконец, происхождение загадочного пигмента. Это заняло время, но сметливый мистер Мухараджи раскопал истину. Пигмент делали в одной из древень в провинции Бихар. Специально отобранных коров кормили манговыми листьями; пигмент был выпаренной мочой этих коров. Листья манго содержат то же едкое вещество, что ядовитый плющ, и коровы заболевали и умирали в мучениях, потому пигмент был так редок.

История несчастных коров наделала много шума, и в Англии поднялась кaмпания по запрету; спрос изчез, и его перестали делать. Сегодня сохранились только редкие образцы, которых не добыть ни за какую цену. Заводчики подобрали по цвету другой пигмент, тартразин, который тоже прозвали "индийским желтым". Названия перепутались, и про "индийский желтый" забыли.

Мои Тернеры были нарисованы тартразином. Я не знал о разнице; не знали о ней и искусствоведы. "Индийский желтый" опознают по спектру. Из-за давней ошибки какого-то разгильдяя, эталонный спектр "индийского желтого", которым все пользовались при экспертизе, был не настоящего пигмента, а тартразина - даже хваленые знатоки принимали один пигмент за другой. Пару лет назад какой-то дока нашел баночку "индийского желтого" и обнаружил ошибку. Мистер Мухараджи оказался прав - пигмент действительно добывали из мочи.

Теперь только дело времени, когда моих Тернеров снимут с музейных стен.

***

Я купил ранчо в Пуэрто-Рико, на котором росло с десяток манговых деревьев. Стоило больших денег звукоизолировать и оборудовать хлев, но что оставалось делать?

По семейным преданиям прадедушка был какое-то время ковбоем в Техасе. Вряд ли прадеду доводилось скармливать манговые листья своим буренкам. Первая подохла от голода, так и не взяв их в рот. Рев этой голодной коровы до сих пор стоит у меня в ушах. Я подкупил ветеринара сделать разрез в боку второй коровы, и через трубку залил взвесь листьев прямо ей в желудок. Корова околела в ту же ночь, даже не помочившись. Я пытался смешивать листья с сеном, я добавлял экстракт в молоко, я выписал за сумасшедшие деньги корову из Бихара. Я угробил целое стадо, не добыв ни грамма пигмента. Моча давала коричневую массу мерзейшего оттенка. Я перепробовал все, абсолютно все. Я проклял мистера Мухараджи, ботаников, химиков, искусствоведов, и всех с ними. Соседи стали подозревать неладное, и пришлось сжечь хлев, чтобы замести следы. Я начал присматривать другую ферму.

Ураган прошел аккурат по дому. Балка придавила мне ноги, и я был беспомощен, мыча от непосильной боли. Когда меня нашли, я был едва жив. Под наркозом я увидел белую корову с женским лицом, от нее сладко пахло мороженым. Она назвалась Нандини - исполняющей желания. Что ты хочешь? - спросила Нандини. - Браме пришлось разрушить твой дом, чтобы ты перестал истязать моих дочерей. Зачем ты не давал им травы? Я рассказал Нандини про мистера Мухараджи. - Сахиб, - сокрушенно вздохнула Нандини, - Мистер Мухараджи никогда не был в Бихаре, свой отчет он написал в калькуттском борделе. Отдай мне ноги, чтобы больше не творить зло, и я научу тебя, как делать "индийский желтый".

***

Мастерскую пришлось переоборудовать под коляску, чтобы я мог подъезжать к мольберту, а другую половину занимают брусья, где я учусь ходить на протезах. Рядом с брусьями стоит ящик с пахучими маленькими манго, которые мне присылают из глухой деревни у подножия Гималаев.

Сначала трудно было жить на одних манго, но сейчас не 19-й век, и моя полка уставлена витаминными банками. Пигмента получается мало, но много и не нужно: сколько я упариваю на спиртовке, столько и уходит за день. Еще неделя-другая и мой новый Тернер будет закончен: белая корова, выбегающая в бурю из охваченного огнем хлева.
3rd-Oct-2018 05:33 pm - Штуковина
thinking
Спасибо, что зашли в лавку. Я Шмидт, слышали про такого? Всю жизнь строгал да клеил, теперь, увы, глаза не те. В мастерской хозяйничает сын, а я иногда сделаю какую-нибудь штуковину, заработать на табачок-с. Не угодно ли взглянуть? Тут целая история... Когда я был моложе, записал; сейчас прочту.

***

В ту весну я сидел без работы. Мы проели материалы, книги, инструменты, мебель. Лица детей побледнели: первые следы голода. Мы мечтали вырваться из Парижа, но в городских предместьях творилось то же самое; побег был бы самоубийственным. Оставалaсь настройкa и починка инструментов, но у кого тогда было желание музицировать? Я впал в апатию.

В дверь опустевшей мастерской постучали - на пороге стояли три господина с революционными кокардами на шляпах; за их спинами переминались гвардейцы с испитыми физиономиями. Один из господ, явно главенствующий в компании, назвался доктором Жозефом Гильотеном из Бордо, а двое других представились гражданами Пьером-Луи Редером и Антуаном Луи из Меца. Д-р Гильотен без проволочек объявил, что они члены Учредительного Собрания и хотели бы заказать механическое устройство деликатного свойства и большой государственной важности.

Я предложил им пройти в мастерскую. Гвардейцы остались снаружи.

Как водится у такого рода господ, они сразу поинтересовались, как я - подданный иностранной державы - отношусь к великой Революции? Я заверил их, что не испытываю добрых чувств к тиранам, и лишь то обстоятельство, что я чужеземец, не дает мне возможности стать горячим патриотом новой Франции. Редер тут же спросил, что я думаю о врагах Франции, не заслуживают ли они безусловной и немедленной смерти? - На это я заметил, что такой вопрос лучше задать нашим добрым парижским санкюлотам. (К тому времени подобные вопросы задавали мне несколько раз на день, и ответы вылетали автоматически, как брикеты из заднего отверстия механической утки, которую я смастерил для госпожи П-р). Д-р Гильотен, вполне удовлетворенный ответами, провозгласил, что, невзирая на мое иноземное подданство, я тоже могу поучаствовать в святом деле смывания нечистой крови с полей отечества. Франция, - с ударением сказал он, - страна братства и равенства, порвавшая с произволом монархов, разрушившая застенки Бастилии и выпустившая узников тирании. Казнь ненавистников свободы должна быть быстрой, но немучительной: молниеносное движение, подобное росчерку пера Марата. Мы не желаем распалять страсти толпы, мы не желаем создавать мучеников из негодяев, предавших народ. Французский народ, которому дробили кости, французский народ, который душили веревками королевские палачи - наш благородный народ желает равенства всех сословий как в жизни, так и в смерти, и поручил нам создать машину для отрубания голов предателям и клятвопреступникам. Готов ли я помочь народу?

Стараясь быть спокойным, я ответил доктору, что в действии двух машин имеется существенное различие: клавикорды создают совершенную мелодию, а их машина отделяет головы от туловищ. Военный инженер или даже мясник были бы более полезны предприятию. Господа засмеялись, и гражданин Луи признался, что не ждал от меня другого ответа.

- Мой друг, - промолвил он, - хотя мясник может стать революционером, революционер - не мясник, а пророк, взывающий к лучшему в человеке. Убийство - побочное, неглавное действие машины. Наша машина - инструмент правосудия, через которое само Провидение играет финальной аккорд над погубленной душой предателя. Как клавесин играет чистую ноту, никого не оставлящую равнодушным, так машина производит ноту сурового, неотвратимого возмездия, вызывающую резонанс в каждом сердце, будь оно полно добродетели или ненависти. Эта машина на долгие века станет символом нашей великой Революции, и она не может быть изделием инженера и ремесленника, а только плодом вдохновения художника, знакомого с музами. И, чтобы я лучше понял замысел, они покажут мне чертеж. При этих словах гражданин Ремер открыл кожанную сумку и развернул рулон бумаги на верстаке.

Взглянув на чертеж, я понял, почему комитет обратился ко мне: машина в точности воспроизводила ударный механизм пианофорте, только молоточек с фетром был заменен на стальной диск. Палач наступал на рычаг, и диск обрушивался острым лезвием снизу на несчастного, чья шея была зажата деревянной колодкой. Я подумал: никто не будет слушать мои инструменты и столетия после таких аккордов.

Я разглядывал чертеж минут десять, перед тем как сослаться на трудности в добыче необходимых материалов. Лицо д-ра Гильотена изобразило сочувствие.
- Шмидт, в материалах у Вас не будет недостатка, и Вас щедро вознаградят за труды, - заверил меня он.
- У нас не всегда есть возможность остановить толпу, осаждающую дом шпиона, - добавил гражданин Луи.
- Вы уже третий мастер, с которым мы беседуем, и Ваши предшественники - те, на ком будет испытана машина, когда Вы ее закончите. Мы еще раз спрашиваем: готовы ли Вы сделать машину? - заключил Редер.

- Революция не забудет бескорыстной помощи в тяжелую минуту - закончил д-р Гильотен, когда я кивнул. - Денег в кошельке должно на первое время хватить. Гвардейцы будут следить, чтобы у Вас не было недостатка в еде и материалах; выходить наружу Вам без надобности. Если испытания пройдут успешно, Вас сопроводят до границ. Доброй ночи, Шмидт.

Гвардейцы расселись на ящиках и запыхтели трубками. Я дал им золотой, и мы первый раз за три месяца поужинали. От еды и вина закружилась голова: я не пил спиртного больше года. Мне приснилaсь деревня, где я вырос. Крестьяне шли на сенокос; у девушек были цветы в волосах, они пели. Солнце только недавно взошло, и трава была мокрой: такую косить проще всего. Стальные полосы колыхались над головами, и я увидел, как луч солнца выглянул из-под лезвия. Неожиданно оно полетело вниз, разрезая воздух, и то же произошло с остальными. Все закончилось в секунду. Тела лежали на траве, и отделенные от туловищ головы с недоумением взирали на кровавые шеи. Я увидел фигуру в черном одеянии; в руке она держала косу. Деревянная рукоятка ударила о землю, тела подобрали головы с травы, и процессия медленно потянулась за черной фигурой. Я пошел за ними, но фигура резко остановила меня жестом.

Проснувшись, я послал гвардейца в Ассамблею. Господа были немало удивлены видеть меня столь скоро, но, когда я показал чертеж, их лица просияли.

- Я рад, сколь высокое мастерство Вы принесли с собою, Шмидт - провозгласил д-р Гильотен, - Как точно уловили Вы, что эпитафией отступнику должен быть не аккорд, а нотное ребро: острая коса Смерти, незримо обрушивающaяся на шею нечестивца. Шуршание веревки, свист воздуха, утренняя роса, лучи восходящего солнца на фоне столбов, низвергание сверкающего лезвия, быстрого как ангел возмездия, посланного из небесных сфер, - я потрясен тем, что Вы, иностранец, так точно уловили суть нашего заказа. Шмидт - Вы мастер и художник, и мне жаль, что человечество не узнает имя истинного творца этого замечательного механизма.

***

Любители платят мне хорошие деньги, но Вы мне понравились, и я сделаю Вам скиду. Это точная копия в миниатюре. Сюда Вы кладете сигару: так, а теперь дергаете за веревочку.
30th-Sep-2018 02:28 pm - На злобу дня
thinking
Пять лет назад я рассказывал про француженку, которая заболела параноей на почве гадских американцев, зажимающих европейских ученых
https://shkrobius.livejournal.com/381022.html
Поскольку она предсказуемо писала безумные отзывы на американские статьи и гранты, эта больная женщина стала самым популярным ревьюером по ее профилю в химических журналах и нескольких агенствах. Достаточно было отклонить просьбу на рецензию с предложением альтернативного кандидата, чтобы сильно задержать/завернуть любую статью/заявку без того, чтобы самому пачкать руки. Доказывай потом, что не верблюд. В итоге практически все в этой области попали под обстрел и могут рассказать колоритнейшие истории.

Когда говорят, что это-де демократы тире грязные политиканы пользуются столь низкопробными способами - использованием нездоровых людей для политических выгод, я сразу вспоминаю этот эпизод. Этим занимались мои собственные коллеги - при первой открывшейся возможности и из-за грошовых выгод. Здоровой эта женщина (кстати, прекрасный химик) не была никому нужна; заболев шизофренией, она оказалась остро востребованной. Единственная разница в том, что использование было анонимным.

***

История имеет хороший конец. В какой-то момент ее начали лечить и... вылечили. Я с ней встретился полтора года назад в Сан Франциско на конгрессе, и мы мило побеседовали; обсуждали возможности совместных работ. Она оставила самое приятное впечатление.
thinking
Видел на шоссе рекламу нового сезона
https://en.wikipedia.org/wiki/The_Man_in_the_High_Castle_(TV_series)
Для первого сезона они выпустили плакаты со Статуей свободы, делающей зиг хайль кораблям (там Америка оккупирована Германией и Японией после атомной бомбардировки Вашингтона) и свастиками по всему Нью-Йорку. Отменный был скандал.

У нас почти все альтернативные истории либо об этом, либо о победе конфедератов над янки. Судьба победившей Конфедерации незавидна: отсталость, бедность, рабство чуть ли не до конца 20-го века, кромешный фашизм - и все это на фоне бурного прогресса в САСШ. Вероятно, по причине избитости сюжета в самой известной книжке такого рода
https://en.wikipedia.org/wiki/Bring_the_Jubilee
все наоборот. Рабство в Конфедерции отменяeтся генералом Ли сразу после окончания Гражданской войны. От САСШ остается узкая полоса вдоль канадской границы. Жизнь там в середине 20-го века напоминает нынешнюю Гватемалу. Конфедерация же превращается в панамериканскую империю. Ее центр находится уже не в Америке, а в Мехико-Сити.

***

Я прочел роман, когда только приехал в Америку, и фантазия казалась безумной.

Чем дольше я живу в Америке, тем менее так кажется. Рабы после войны стали архаизмом из-за механизациии и низкой производительности; в Бразилии и на Кубе рабство было отменено декретами сверху. Война с Мексикой и совместная экспансия до Панамы (а то и далее) представляются закономерными. Такая экпансия как минимум решила бы проблему, что делать со вчерашними рабами. В Америке, всегда были сильны антикатолические настроения, но их центр находился в Новой Англии, а не на Юге. Америка присоединила Луизиану, Пуэрто Рико; в нее эмигрировало немало католиков с Юга. Сплав Юга с Латинской Америкой изменил бы характер обоих, получился бы этакий супер-ТексМекс. Стену сегодня строили бы через Мейсон-Дикси линию, и не для мигрантов с юга. Целая историческая судьба была потеряна для континента. Пожалуй, во многих аспектах она была бы предпочтительнее нынешней.

Столько стона стоит про синие и красные штаты, но они б/м повторяют установившееся деление, которое проявит себя в любом раскладе. Даже если сбудутся мечты о пролетарской революции в Америке, нет сомнений, по какой географической линии будет идти борьба большевиков с троцкистско-зиновьевской оппозицией.



PS https://en.wikipedia.org/wiki/Albion%27s_Seed
https://fencingbearatprayer.blogspot.com/2016/02/founding-freedoms-four-square.html
thinking
Послушал утром сенатские прения по радио, напомнило незабвенную классику:

...Ж е л а т е л ь н о у з н а т ь, не соблаговолит ли новый кандидат в губернаторы разъяснить тем из своих сограждан, которые отваживаются голосовать за него, одно любопытное обстоятельство: правда ли, что у его товарищей по бараку в Монтане то и дело пропадали разные мелкие вещи, которые неизменно обнаруживались то в карманах мистера Твена, либо в его "чемодане" (старой газете, в которую он заворачивал свои пожитки). Правда ли, что товарищи были вынуждены наконец, для собственной же пользы мистера Твена, сделать ему дружеское внушение, вымазать дёгтем, вывалять в перьях, и пронести по улицам верхом на шесте, а затем посоветовать поскорей очистить занимаемое им в лагере помещение и навсегда забыть туда дорогу? Что ответит на это мистер Марк Твен?

...К л е в е т н и к у л и ч ё н ! Майкл О`Фланаган - эсквайр из Файв-Пойнтса, мистер Снаб Рифферти и мистер Кэтти Маллиган с Уотер-стрит под присягой дали показания, свидетельствующие, что наглое утверждение мистера Твена, будто покойный дед нашего достойного кандидата мистера Блэнка был повешен за грабёж на большой дороге, является подлой и нелепой, ни на чём не основанной клеветой. Каждому порядочному человеку станет грустно на душе. При виде того, как ради достижения политических успехов некоторые люди пускаются на любые гнусные уловки, оскверняют гробницы и чернят честные имена усопших. При мысли о том горе, которое эта мерзкая ложь причинила ни в чём не повинным родным и друзьям покойного, мы почти готовы посоветовать оскорблённой и разгневанной публике тотчас же учинить грозную расправу над клеветником. Впрочем, нет! Пусть терзается угрызениями совести! (Хотя, если наши сограждане, ослеплённые яростью, в пылу гнева нанесут ему телесные увечья, совершенно очевидно, что никакие присяжные не решатся их обвинить и никакой суд не решится присудить к наказанию участников этого дела.)

http://magazines.russ.ru/slovo/2010/66/tv7.html
https://loa-shared.s3.amazonaws.com/static/pdf/Twain_Running_Governor.pdf
23rd-Sep-2018 12:56 pm - Злоязычие
thinking
На праздниках я собрался с духом и прочел трактат "Хафец хаим" о злоязычии. См. англ. перевод
https://torah.org/series/halashon/
(я нашел русский перевод, но он очень вольный). Трактат оказался исключительной ясности и актуальности.

Под влиянием книги, а так же недавнего жж скандала, затрагивающего знакомых, я решил более активно пресекать злоязычие в этом журнале. Это означает стирание комментариев, замораживание веток, и в некоторых случаях - бан с предупреждениями или без. Я вижу его развращающее влияние, в.т.ч. и на меня самого. Правдивость злоязычия является не облегчающим, а отягчающим обстоятельством.

Если Вы не можете ответить на комментарий, но не извещены, что забанены, это означает подобного рода чистку, и я прошу прощения за доставленное неудобство.

***

Трактат я читал на фоне политического скандала в Америке, который иллюстрируют последствия нарушения законов о злоязычии.

Второзаконие 19:15 учит, что "недостаточно одного свидетеля против кого-либо в какой-нибудь вине и в каком-нибудь преступлении и в каком-нибудь грехе, которым он согрешит: при словах двух свидетелей, или при словах трех свидетелей состоится дело." Одиночное публичное обвинение, независимо от того, является оно правдивым или ложным, является безусловным примером злословия,
https://torah.org/learning/halashon-intrcomm/
имеющего своей целью очернение ответчика. Такое заявление морально эквивалентно нарушению трех из десяти заповедей и должно рассматриваться соотв. образом.
23rd-Sep-2018 11:47 am - Научная грамотность
thinking
В последнем номере Physics Today
https://physicstoday.scitation.org/doi/abs/10.1063/PT.3.4019
статья с незнакомыми мне примерами в стиле "научной грамотности". Два из них понравились.

Задача 1. Если посмотреть на поверхность листа, расстояния между устьицами гораздо больше, чем размеры устьиц. Если посмотреть на химические рецепторы на поверхности клетки, расстояния между ними гораздо больше, чем размеры рецептора. Кажется, что большая плотность устьиц и рецепторов должна давать преимущество, но это не так. Почему?

Задача 2. Ничего не зная о механизме движения, как из биений жгутика спрематозоида установить, создается его волнообразное движение "моторчиком" в клетке или самим жгутиком?



Ответы:Collapse )
thinking
Два года назад я рассуждал, почему с химической точки зрения вполне очевидно, что биополимеры, ответственные за хранение/копирование информации (нуклеиновые кислоты) и метаболизм (белки) должны быть разными (к ним предъявляются слишком разные требования)
https://shkrobius.livejournal.com/576657.html?thread=10477201#t10477201

Втч я предложил, что надежность копирования прото-нуклеиновых кислот с самого начала д. б. > 1е-4, т.к. иначе возникнут ошибки в структуре почти всех белковых комплексов (требующих примерно столько нуклеотидов для кодирования), и машинерия клетки не сможет надежно работать. Меня тут же спросили, почему? - и я не смог дать полностью удовлетворительного ответа.

Я обсуждал этот вопрос с молбиологами, но беседы не "пошли". Химику и молбиологу особенно трудно представить обратную ситуацию, т.к. ДНК и ДНК полимераза специально подобраны, чтобы ошибки копирования были < 1е-6. Так можно обсуждать, как жили бы люди, если бы у них ноги были длиной с милю. Если бы у них были такие ноги, то они бы не жили; конец обсуждения.

***

С тех пор у меня появились некоторые соображения.

Исходная точка рассуждения - аналогия с передачей информации в ненадежных системах коммуникации. Проблема решается дроблением потока информации на небольшие куски и подсчетом контрольных сумм, хешированием и т. д.
https://en.wikipedia.org/wiki/Checksum
Если блок передан с ошибкой, его передают его еще раз, пока не получают точную копию. Это расточительно, но что делать... Вопрос в том, как превратить эту аналогию в реалии репликации генома.

В случае частых ошибок копирование всего генома целиком безнадежно, но можно (по аналогии) копировать его ген за геном и проверять каждый ген отдельно. Точность копирования гена можно определить его транскрипцией, синтезом энзима и проверкой энзима на функциональность. Если энзим функционален - значит кодирующий участок воспроизведен удовлетворительно. К сожалению, невозможно соорудить универсальную "проверялку" функциональности, и потому задача кажется безнадежной. Я вспомнил, что в любом геноме (включая наш собственный)
http://www.pnas.org/content/107/12/5429
http://rspb.royalsocietypublishing.org/content/early/2010/07/03/rspb.2010.1052
https://en.wikipedia.org/wiki/Overlapping_gene
есть немало участков, одновременно кодирующих два белка из-за сдвинутой рамки считывания. Это свойством можно воспользоваться, чтобы сделать биологический аналог контрольной суммы. "Контролем" функционального белка служит белок, синтезированный из той же последовательности, но со сдвинутой рамкой. Если второй (контрольный) белок нефункционален, нефункционален и первый белок. Остается придумать универсальную функцию контрольного белка - но эта функция очевидна из самой задачи.

Репликационная система может работать так. Рядом с каждым кодирующим участком находится некодирующая последовательность. "Контрольный" белок кодирующего участка уникально связывается с этим регуляционным участком. По факту связи между ними можно установить, что репликация регуляционного участка и кодирующей последовательности (для функционального и "контрольного" белка) были успешны. Мы знаем, что материнские последовательности безошибочны. Полимераза создает новые последовательности на основе комплементарных материнских цепочек, и они сразу транскрибируются в два белка. "Контрольные" белки каждой последовательности садятся на регулирующие участки, и служат промотерами дальнейшей репликации. Если промотер не связался с своим участком, геликазы убирают новые цепочки и репликация повторяется, пока не образуется функциональный промотер. Такая репликация продолжается от одной кодирующей последовательности к другой.

Эта репликации далека от того, что существует сегодня, хотя она содержит в себе многие элементы ныне существующей системы. Природа не пошла по пути "контрольных сумм", т.к. гораздо проще повысить надежность полимераз. Зачем же себе такое воображать? Подобной системе может не быть альтернативы, если энзиматические и информационные функции не полностью разделены.

Наверно, химически ненадежная репликация в клетке возможна, хотя она сложна и неэффективна, так как ее необходимо сделать надежной на системном уровне. Я не думаю, что проблема тут в недостатке моего воображения; это объективно трудно.
This page was loaded Nov 14th 2018, 12:59 pm GMT.